每種滅菌烘箱都有其特定的適用范圍，而每種物料都可找到若干種能滿足基本要求的干燥裝置，但適合的只能有一種。如選型不當，用戶除了要承擔不必要的一次性高昂采購成本外，還要在整個使用期內付出沉重的代價，諸如效率低、耗能高、運行成本高、產品質量差、甚至裝置根本不能正常運行等等。
以下是滅菌烘箱選型的一般原則，很難說哪一項或哪幾項是重要的，理想的選型必須根據自己的條件有所側重，有時折中是必要的。
1.適用性-------滅菌烘箱須能適用于特定物料，且滿足物料干燥的基本使用要求，包括能很好的處理物料(給進、輸送、流態化、分散、傳熱、排出等)，并能滿足處理量、脫水量、產品質量等方面的基本要求。
2.干燥速率高---僅就干燥速率看，對流干燥時物料高度分散在熱空氣中，臨界含水率低，干燥速度快，而且同是對流干燥，干燥方法不同臨界含水率也不同，因而干燥速率也不同。
3.耗能低-------不同干燥方法耗能指標不同，一般傳導式干燥的熱效率理論上可達99%，滾筒滅菌烘箱廠家，對流式干燥只能70%左右。
4.節省投資-----完成同樣功能的干燥裝置，有時其造價相差懸殊，應擇其低者選用。
5.運行成本低---設備折舊、耗能、人工費、維修費，備件費...等運行費用要盡量低廉。
6.優先選擇結構簡單、備品備件供應充足、可靠性高、壽命長的干燥裝置。
7.符合環保要求，工作條件好，安全性高。
8.選型前較好能做出物料的干燥實驗，深入了解類似物料已經使用的干燥裝置(優缺點)，往往對恰當選型有幫助。
